Sementara di permukaan, Yuu Otosaka tampaknya hanyalah remaja yang menarik dan cerdas, ia memiliki rahasia — ia memiliki kemampuan untuk menyelinap ke dalam pikiran orang dan sepenuhnya mengendalikan tubuh mereka selama lima detik setiap kali. Yuu telah menggunakan keterampilan ini selama bertahun-tahun untuk mendapatkan nilai tertinggi, yang memungkinkan dia untuk memasuki sekolah menengah yang bergengsi. Ketika Nao Tomori yang misterius menangkap Yuu menggunakan kekuatannya, dia memaksa dia dan saudara perempuannya Ayumi untuk pindah ke Akademi Hoshinoumi, sebuah sekolah untuk siswa dengan kemampuan supranatural. Dewan siswa sekolah, yang dipimpin oleh Nao, ditugaskan untuk secara diam-diam melacak remaja yang menyalahgunakan kekuasaan mereka. Yuu dipaksa untuk bergabung dengan OSIS dan bersama-sama, mereka menghadapi tantangan berat yang membawanya lebih dekat ke kebenaran yang mengejutkan bahwa kemampuannya sendiri, yang tampaknya tidak lengkap, mungkin lebih kuat daripada yang bisa dia bayangkan. Sebuah kisah asli dari Jun Maeda, pencipta Angel Beats dan Clannad, Charlotte mengeksplorasi kehidupan supranatural dari para remaja ini dan harga yang harus mereka bayar untuk menjadi istimewa. [Ditulis oleh Animasu Menulis Ulang]