Hanayamata: Naru Sekiya adalah seorang gadis berusia 14 tahun rata-rata dengan kecerdasan rata-rata, atletis rata-rata, dan bakat rata-rata. Dia pernah memiliki harapan bahwa mulai sekolah menengah akan mengubah semua itu. Sayangnya, kenyataan tidak bisa jauh dari kebenaran dan dia tetap menjadi wallflower. Mengapa kehidupan nyata tidak bisa seperti dongeng di mana seorang pangeran tampan mengangkat seorang gadis miskin dari ketidakjelasan dan mengubahnya menjadi seorang putri yang mempesona? Kehidupan siswa umumnya berubah ketika dia bertemu dengan seorang gadis berambut pirang menari di atas pintu gerbang ke kuil. Naru menganggap gadis itu peri, tapi ternyata dia juga gadis biasa. Tapi kebetulan juga dia adalah murid pindahan bernama Hana dari Amerika yang jatuh cinta pada yosakoi, sejenis tarian, dan datang ke Jepang dengan niat untuk memulai klubnya sendiri! Merasa senang karena dia teman sekelas dengan gadis yang ditemuinya malam sebelumnya, Hana mencoba merekrut Naru untuk menjadi anggota pertama dari klub yosakoi baru. Sayang sekali kalau menari di depan semua orang membuatnya takut! Bisakah Hana meyakinkan Naru untuk bergabung dengan klub? Akankah Naru jatuh cinta pada yosakoi? Cari tahu di Hanayamata!